Mitte April 1945 legte ein alliierter Luftangriff das alte Zentrum der Stadt in der Nähe des Hauptbahnhofes in Schutt und Asche. Historische Gebäude wie das Stadtschloss und die Garnisonkirche brannten nieder. Die Rote Armee nahm die Stadt im Zuge der Einkesselung Berlins am 27.April 1945 ein.
Vom 17. Juli bis zum 2. August 1945 fand im 1916 für den preußischen Kronprinzen errichteten Schloss Cecilienhof die Potsdamer Konferenz (auch „Berliner Konferenz“) statt. Auf ihr diskutierten die Staatsoberhäupter der Siegermächte – für die UdSSR Generalissimus Stalin, für die USA Präsident Truman und für Großbritannien Premierminister Churchill, später Attlee – der „Antihitlerkoalition“ wichtige Fragen der Behandlung Deutschlands nach dem Krieg, welche als „Potsdamer Abkommen“ bekannt wurden.